配信統合サイト（電子書籍販売サイト）
■ニコニコ静画：ニコニコのコンテンツ。
■Yahoo!ブックストア – 電子書籍がいつでも楽しめる！
Yahoo！の電子書籍販売サイトだが、無料のもの、独自コンテンツも多数存在。
独立系Webコミックサイト
講談社系
■モーニング・アフタヌーン・イブニング合同Webコミックサイト モアイ：講談社のモーニング、アフタヌーン、イブニングの合同サイト。
■月曜更新!! 伝説の『ヤングマガジン海賊版』が復活！：講談社。月曜更新。投稿作品のコミック化という不思議な位置づけ。
■想像系新雑誌「ＩＴＡＮ」｜TOP｜講談社コミックプラス：講談社。想像系新雑誌と称する。
■Kiss TOPページ｜Kiss | 講談社｜講談社コミックプラス：講談社。女性向け。若干Ｗｅｂ連載あり。
■ツイ4 | 最前線：星海社の4コマ専門。Twitterで毎日流している
小学館
■サンデーうぇぶり ：少年サンデー+ゲッサン+サンデーGX系。旧クラブサンデー。
■裏サンデー：少年サンデー系。表に比べ企画色強い。
■やわらかスピリッツ：小学館スピリッツ系。
集英社・白泉社系
■となりのヤングジャンプ：集英社。
■ウルトラジャンプ Web連載：集英社ウルトラジャンプ内のＷｅｂコミックコーナー。
■WEBオリジナル｜集英社グランドジャンプ：集英社。
■コミック・小説一覧｜週プレNEWS［週刊プレイボーイのニュースサイト］：集英社。週刊プレイボーイ内のコンテンツ。
■ヤングアニマルDensi：白泉社ヤングアニマル系。毎週金曜日更新。
■花とゆめONLINE：白泉社花とゆめ系。女性向け。
■ぷら＠ほ～む：ホーム社のＷｅｂコミックサイトが統合されたもの
■画楽ノ杜 : コミック新大陸へ!!：ホーム社。
KADOKAWAグループ
■ComicWalker – 人気マンガが無料で読める！：角川書店iOSアプリもあり。
■ファミ通コミッククリア ｜ 無料漫画サイト：アスキー・メディアワークス。ファミ通.com内。ゲーム系コミック多し。
■人気ゲーム・アニメの４コマ＆美少女コミック｜マジキューコミックスウェブ
■Webコミック | 月刊コミック電撃大王公式サイト：電撃大王サイト内コンテンツ。
■週刊アスキーPLUS：週アスCOMIC：週刊アスキープラス内
■コミックエッセイ劇場：メディアファクトリー。
双葉社
■ WEBコミックアクション：毎週金曜日更新。双葉社。WEBコミックハイ！などを統合した双葉社のサイト。さらに前進は無料Webコミックサイトの草分け『コミックシード』。
竹書房
■まんがライフWIN：竹書房。4コマ系中心。
■ゆるっとcafeｔ：竹書房。エッセイコミックなどゆるめのもの多い。
■すくすくパラダイスぷらす｜すくパラ倶楽部：竹書房。育児系。
■WEBコミックガンマ 公式サイト：竹書房。
スクウェアエニックス
■ガンガンONLINE：スクウェアエニックス運営。現在のWebコミック最大手かも。
その他
■コミック | ぱれっとonline | 一迅社オンライン：一迅社ぱれっとのサイト。
■コミック | ゼロサムオンライン | 一迅社オンライン：一迅社コミックゼロサム系。主に女性向け。
■マッグガーデン・コミック・オンライン：マッグガーデン。コミックブレイド系など。
■COMICポラリス：アプリックス。
■COMICメテオ：アプリックス。
■最前線 – フィクション・コミック・Webエンターテイメント：星海社。小説（ラノベ）コンテンツも目立つ。
■[ comic RYU web ] > webコミック予告：徳間書店コミックリュウ系。
■マンガごっちゃ ：マイクロマガジン。Ｗｅｂ投稿誌の性質も持つ。
■コミックエッセイルーム｜CREA WEB（クレア ウェブ）：文藝春秋社。
■ぽこぽこ – ホメられて伸びるタイプのweb連載空間：太田出版。
■Champion タップ！：秋田書店
■日本文芸社 | ゴラクエッグ：日本文芸社。ゴラク系。
■コミックダンガン -ホビージャパン無料WEBコミック-：ホビージャパン。
■コミックヴァルキリー 公式サイト：キルタイムコミュニケーション。
■大人が本気でおもしろい！マンガを集めた「クロフネZERO」 乙女たち をきゅんとさせる、トキメキいっぱい「クロフネ百（モモ）」：2つのサイトの合同トップ。女性向け。
■WEB連載コミック リラックマ、ほか/主婦と生活社：主婦と生活社。
■漫画街：マンガ編集プロダクション銀杏社のサイト。歴史は古く、わりと読めるものが多かったです。
■FEEL YOUNG：FEEL YOUNGのサイト。女性向けか。
■WEBコミックトム：潮出版社。Ｗｅｂ配信コミック若干存在。
■SPOMA（スポマ）：スポーツマンガ特化。
■沖縄コミックチャンプルー：あびぃ堂。沖縄ローカルマンガという、ある意味不思議な位置づけのもの。
更新終了サイト
※完全リンク切れのサイトは消しています。
■まんがタイムきららWeb：『まんがタイムきらら』のサイト。『ふおんコネクト！』の外伝『みちかアクセス！』があったが長期更新停止。
■コミックHOLIC：とらのあな配信。2014年1月より更新停止。
■スーパーダッシュ＆ゴー！｜スーパーダッシュ文庫発メディアミックスコミック誌!!：集英社。更新終了。文庫紹介に。
■ソリッドオンライン – 少年ソリッド：更新終了。
■ＭＥＣＬ……2011年6月終了。コンテンツも消失。
■Manga Samurai Style：学習研究社。サムライ特化。2016年3月31日終了。
■「少年シリウス」オフィシャルサイト｜WEB企画：講談社少年シリウスのＷｅｂ企画サイトの位置づけ。2017年3月消滅確認。
■くらげバンチ：新潮社コミックバンチ系。2017年3月消滅確認。
■WEBイキパラCOMIC：小学館COMIC IKKI系。
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■参考：日本のウェブコミック配信サイト一覧 – Wikipedia